Pese a que no mejoró la condición climática en el trazado portugués y la lluvia volvió a ser protagonista a lo largo de toda la tanda, las Honda pudieron ser las motos más veloces de la práctica nuevamente pero ahora con Pol Espargaró por delante de su compañero de equipo Marc Márquez, cerrando un gran viernes para el equipo oficial.
Detrás de ellos apareció la dupla italiana formada por Andrea Dovizioso y Francesco Bagnaia, aunque no dupla de equipo ya que corren para Yamaha y Ducati respectivamente. La marca de los tres diapasones logró mejorar considerablemente respecto al primer entrenamiento, en el que la referencia de dicho fabricante había sido Quartararo desde la 18va colocación.
Más atrás en el clasificador y habiendo sufrida una dura caída en el cierre de la jornada, Maverick Viñales puso a la mejor Aprilia en el clasificador en el puesto ocho, mientras que Miguel Oliveira volvió a ser el mejor entre los corredores de KTM. Suzuki no pudo cerrar bien el viernes y fue relegada a la undécima colocación en manos de Joan Mir.
| Pos. | # | Piloto | Marca | Tiempo | Dif. | Vueltas |
| 1 | 44 | Pol Espargaró | Honda | 1’50.707 | – | 8 |
| 2 | 93 | Marc Márquez | Honda | 1’51.318 | 0.611 | 8 |
| 3 | 4 | Andrea Dovizioso | Yamaha | 1’51.756 | 1.049 | 16 |
| 4 | 63 | Francesco Bagnaia | Ducati | 1’51.789 | 1.082 | 8 |
| 5 | 89 | Jorge Martín | Ducati | 1’51.794 | 1.087 | 8 |
| 6 | 73 | Álex Márquez | Honda | 1’51.874 | 1.167 | 17 |
| 7 | 21 | F.Morbidelli | Yamaha | 1’51.911 | 1.204 | 11 |
| 8 | 12 | Maverick Viñales | Aprilia | 1’51.925 | 1.218 | 9 |
| 9 | 30 | Takaaki Nakagami | Honda | 1’52.046 | 1.339 | 16 |
| 10 | 88 | Miguel Oliveira | KTM | 1’52.100 | 1.393 | 20 |
| 11 | 36 | Joan Mir | Suzuki | 1’52.306 | 1.599 | 9 |
| 12 | 5 | Johann Zarco | Ducati | 1’52.320 | 1.613 | 11 |
| 13 | 20 | Fabio Quartararo | Yamaha | 1’52.534 | 1.827 | 10 |
| 14 | 23 | Enea Bastianini | Ducati | 1’52.582 | 1.875 | 12 |
| 15 | 87 | Remy Gardner | KTM | 1’52.965 | 2.258 | 15 |
| 16 | 72 | Marco Bezzecchi | Ducati | 1’53.003 | 2.296 | 11 |
| 17 | 43 | Jack Miller | Ducati | 1’53.103 | 2.396 | 12 |
| 18 | 41 | Aleix Espargaró | Aprilia | 1’53.302 | 2.595 | 10 |
| 19 | 33 | Brad Binder | KTM | 1’53.527 | 2.820 | 17 |
| 20 | 42 | Alex Rins | Suzuki | 1’54.327 | 3.620 | 15 |
| 21 | 40 | Darryn Binder | Yamaha | 1’54.385 | 3.678 | 16 |
| 22 | 32 | Lorenzo Savadori | Aprilia | 1’54.876 | 4.169 | 10 |
| 23 | 49 | Fabio Di Giannantonio | Ducati | 1’55.571 | 4.864 | 15 |
| 24 | 25 | Raúl Fernández | KTM | 1’56.330 | 5.623 | 9 |
| 25 | 10 | Luca Marini | Ducati | 1’58.592 | 7.885 | 7 |
